自叙凡例卷一中风类中伤风中寒伤寒劳复、食复、女劳复、阴阳易卷二温热病瘟疫大头瘟暑湿消渴火霍乱泄泻伤食不食卷三疟痢疟痢呃逆厥痉疝气冲眩晕卷四虚损痨瘵恶寒发热血证衄血下血溺血汗卷五七情喜怒忧思悲恐惊郁诈病
序一序二自序跋凡例太极图（图缺）命门水火图（图缺）五气图（图缺）卷之一医论命门水火图说五气图说论膀胱者州都之官津液藏焉气化则能出矣论补脾补肾治血贵静广嗣方论论诸痿胃气当察辨利痢脉病之殊治病求本驳诸家痨
上品卷第一玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石芒硝滑石紫石英白石英青石脂赤石脂黄石脂白石脂黑石脂太一禹余粮禹余粮青玉白玉髓璧玉合玉石陵石碧石青五羽石石流青石流赤六芝赤箭龙眼猪苓茯苓茯神
第1部分第2部分第3部分第4部分第5部分
黄帝素问灵枢叙自序卷一 刺法九针十二原一小针解二九针论三官针四终始五官能六卷二 刺法刺节真邪七逆顺八行针九血络论十论勇十一论痛十二五邪十三五乱十四五禁十五玉版十六师传十七外揣十八禁服十九卷三 经络经脉
铜人鍼灸经
辨症玉函
上卷临症以验舌为准统论验舌分虚实法验舌分阴阳法验舌分脏腑配主方法验舌决生死法临症以验舌为准结语下卷方略泻火清肝饮方滋水生肝饮方逍遥散加生地薄荷方逍遥散加丹皮山栀方十味温胆汤去枳实方当归建中汤去胶饴方七
自序例言卷一禀赋源流总论摄养为本总论卷二阴阳脏腑总论卷三营卫经络总论卷四上四诊合参总论卷四下经解格阳关阴脉脉应四时阴阳脉候部位脉象辨病诊脉察色观形经脉应四时十二月五脏绝脉五脏脉象辨脉平病死旺之象辨平病
序序二附录十二经见证不治已病治未病亢则害承乃制审察病机无失气宜能合色脉可以万全治病必求于本卷一中风一中寒二（附伤寒、伤风）中暑三（附暑风、注夏）中湿四瘟疫五（附大头天行病）火六卷二斑疹七疟八痢九泄泻十